Výzkumná skupina Roberta Váchy

Články

• Enhanced diffusion through multivalency

  BARTOŠ Ladislav LUND Mikael VÁCHA Robert

  Článek v odborném periodiku

  SOFT MATTER, rok: 2025, ročník: 21, vydání: 2, DOI

• Free Energy of Membrane Pore Formation and Stability from Molecular Dynamics Simulations

  RIVEL Timothée Emmanuel Jonathan BIRIUKOV Denys KABELKA Ivo VÁCHA Robert

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Chemical Information and Modeling, rok: 2025, ročník: 65, vydání: 2, DOI

• gorder: Comprehensive tool for calculating lipid order parameters from molecular simulations

  BARTOŠ Ladislav PAJTINKA Peter VÁCHA Robert

  Článek v odborném periodiku

  SoftwareX, rok: 2025, ročník: 31, vydání: September, DOI

• Lipid Scrambling Pathways in the Sec61 Translocon Complex

  JAVANAINEN Matti ŠIMEK Jan TRANTER Dale O´KEEFE Sarah KARKI Sudeep BIRIUKOV Denys ŠACHL Radek PAAVILAINEN Ville O.

  Článek v odborném periodiku

  Journal of the American Chemical Society, rok: 2025, ročník: 147, vydání: 19, DOI

• Martini 3 Limitations in Phospholipid Flip-Flop

  KROUTIL Ondřej BARTOŠ Ladislav KABELKA Ivo VÁCHA Robert

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Chemical Theory and Computation, rok: 2025, ročník: 21, vydání: 19, DOI

• Redefining the role of IL-18 in post-surgical recovery and sepsis: a key mediator of inflammation resolution

  PAPATHEODOROU Ioanna BLAZKOVA Gabriela BOSÁKOVÁ Veronika TOMÁŠIKOVÁ Zuzana SPEARING Erin Rose KLIEBER Robin OSTASOV Pavel ŠTÍCHOVÁ Julie DVONČOVÁ Martina MÝTNIKOVÁ Alexandra EMMER Jan BENDÍČKOVÁ Kamila TOMÁŠ Tomáš ŠRÁMEK Vladimír KOLOVOS Petros HOLUBOVA Monika HELÁN Martin VLKOVÁ Marcela FRIČ Jan HORTOVÁ KOHOUTKOVÁ Marcela

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Translational Medicine, rok: 2025, ročník: 23, vydání: 1, DOI

• Role of Divalent Ions in Membrane Models of Polymyxin-Sensitive and Resistant Gram-Negative Bacteria

  SAVENKO Mariia VÁCHA Robert RAMSEYER Christophe RIVEL Timothée Emmanuel Jonathan

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Chemical Information and Modeling, rok: 2025, ročník: 65, vydání: 3, DOI

• Specific inhibition of fibroblast growth factor receptor 1 signaling by a DNA aptamer

  ZLÍNSKÁ Vladimíra FEKETOVÁ Zuzana CZYREK Aleksandra Anna CHUDZIAN Julia ZIVKOVIC Martina Lenarcic URSACHI Vlad-Constantin DUDEJA Pooja FAFÍLEK Bohumil RYNEŠ Jan RICO LLANOS Gustavo KOUDELKA Adolf ROY Tanaya BIADUN Martyna RAŠKOVÁ Vendula SVOZILOVÁ Kateřina STROBLOVÁ Michaela KRZYSCIK Mateusz HRISTOVA Kalina KROWARSCH Daniel TRANTÍRKOVÁ Silvie ZAKRZEWSKA Malgorzata TRANTÍREK Lukáš KREJČÍ Pavel

  Článek v odborném periodiku

  MOLECULAR THERAPY-NUCLEIC ACIDS, rok: 2025, ročník: 36, vydání: 1, DOI

• Split Membrane: A New Model to Accelerate All-Atom MD Simulation of Phospholipid Bilayers

  KHODAM HAZRATI Mehrnoosh SUKENÍK Lukáš VÁCHA Robert

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Chemical Information and Modeling, rok: 2025, DOI

Ostatní aplikované výsledky

• gorder: Everything you will ever need for lipid order calculations

  BARTOŠ Ladislav PAJTINKA Peter VÁCHA Robert

  Software

  Rok: 2025