Informace o projektu
Analýza párování a rekombinace homeologních chromosomů u (paleo)polyploidních druhů brukvovitých (Brassicaceae)

Amfidiploidní genom řepky olejky (Brassica napus, 2n=38, AC genom) vznikl hybridizací diploidních brukví B. oleracea (C, 2n=18) a B. rapa (A, 2n=20). Dr. Jenczewski et al. prokázali rozdílnou frekvenci rekombinace mezi homeologními chromosomy a výskyt chromosomových přestaveb u vybraných haploidních linií B. napus (n=19). Cílem projektu je detailní molekulárně-cytogenetická analýza meioticého párování homeologních chromosomů v genomu B. napus. Nezbytným předpokladem této analýzy je identifikace A a C chromosomů pomocí chromosomově specifických cytogenetických markerů. Efektivní metodou se v tomto směru ukázal být chromosomální painting, využívající chromosomově specifické BAC klony Arabidopsis thaliana a B. rapa, v kombinaci s in situ lokalizací genomově specifických centromerických sekvencí a rDNA sond. Chromosomální painting s většími DNA sondami (BAC kontigy) bude také použit k charakterizaci potenciálních chromosomových přestaveb v genomu B. napus. Komparativní analýza karyotypu a homeologního párování chromosomů bude zaměřena na i na další příbuzné paleohexaploidní druhy z tribu Brassiceae, studované v laboratoři dr. Lysáka. Zkušenosti francouzského týmu s interpretací meiotického chromosomového párování budou využity při analýze evoluce karyotypu u dalších (paleo)polyploidních druhů z čeledi brukvovitých (Brassicaceae).