Cílem projektu je odhalit regulační vztahy mezi transkripčním faktorem kódovaným MONOPTEROS (MP) a jím řízenými cílovými geny během procesu somatické embryogeneze (SE) závislé na auxinu u Arabidopsis. PB1 doména MP je nezbytná pro jeho transkripční represi při nízkých hladinách auxinu. Alternativním sestřihováním vzniká izoforma MP11ir, jejímž výsledkem je zkrácený protein MP bez domény PB1. Předběžné studie polského a českého týmu identifikovaly MP11ir během procesu SE v Arabidopsis. Tento výzkum zmapuje mechanismus působení MP11ir a MP během procesu SE vytvořením genetické sítě MP11ir
/MP. Technikou greenCUT&RUN bude sestaven seznam genů pod jejich přímou kontrolou, filtrovaných pro jejich rozdílnou expresi během embryogenního přechodu bioinformatickou analýzou. Vybrané kandidátní geny budou funkčně posouzeny. Projekt identifikuje a charakterizuje nové geny s klíčovou úlohou v embryogenních přechodech přímo regulovaných MP11ir/MP a rozšíří znalosti o úloze izoforem ve vývoji rostlin.

Cíle udržitelného rozvoje

Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.

Publikace