Site-specific Analysis of Protein Hydration Based on Unnatural Amino Acid Fluorescence.

• Autoři: AMARO M.; BREZOVSKÝ Jan; KOVÁČOVÁ Silvia; SYKORA J.; BEDNÁŘ David; NĚMEC Václav; LIŠKOVÁ Veronika; KURUMBANG Nagendra Prasad; BEERENS Koen; CHALOUPKOVÁ Radka; PARUCH Kamil; HOF Martina; DAMBORSKÝ Jiří
• Rok publikování: 2015
• Druh: Článek v odborném periodiku
• Časopis / Zdroj: Journal of the American Chemical Society
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• www: http://loschmidt.chemi.muni.cz/peg/wp-content/uploads/2015/04/jacs15.pdf
• Doi: http://dx.doi.org/10.1021/jacs.5b01681
• Obor: Biochemie
• Klíčová slova: dehalogenases;fluorescence spectroscopy;molecular dynamics simulations
• Popis: Hydration of proteins profoundly affects their functions. We describe a simple and general method for site-specific analysis of protein hydration based on the in vivo incorporation of fluorescent unnatural amino acids and their analysis by steady-state fluorescence spectroscopy. Using this method, we investigate the hydration of functionally important regions of dehalogenases. The experimental results are compared to findings from molecular dynamics simulations.

Související projekty

• Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí
• Structure-functional Relationships of Haloalkane Dehalogenases
• Zaměstnáním nejlepších mladých vědců k rozvoji mezinárodní spolupráce
• Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí
• Velká infrastruktura CESNET