Informace o publikaci
Srovnání fylogeneze bělozubek (Eulipotyphla: Crocidurinae) subsaharské Afriky založené na mitochondriálních a jaderných markerech
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2025 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Pochopení fylogenetických vztahů mezi druhy je jedním z hlavních předpokladů pro kompletní poznání biodiverzity na naší planetě. Přestože v posledních desetiletích průběžně dochází k výraznému nárůstu dostupných genetických dat, evoluční historie některých živočišných skupin zůstává stále nevyřešena. Jedním z takových případů jsou bělozubky (Soricidae: Crocidurinae) v subsaharské Africe. Tato podčeleď v současném pojetí zahrnuje šest rodů (Crocidura, Paracrocidura, Ruwenzorisorex, Scutisorex, Suncus a Sylvisorex) a 136 druhů. Většinu druhů bělozubek lze jen velmi obtížně morfologicky odlišit, což zapříčinilo významný taxonomický chaos s řadou nerozlišených taxonů a stále platných synonym; a je tedy vhodné využít genetických metod. Nejčastěji používaným genetickým markerem pro druhovou identifikaci drobných savců je mitochondriální cytochrom b (cytB). Z dostupných 4671 sekvencí jsme sestavili fylogenetický strom a z hlavních linií vybrali jedince pro sekvenování markerů UCE (Ultraconserved Elements) napříč genomem. Cílem bylo zahrnout co největší část mezi- i vnitrodruhové mitochondriální diverzity bělozubek subsaharské Afriky. Na základě UCE se podařilo rekonstruovat téměř kompletně vyřešený fylogenomický strom. Druhy rodů Suncus a Sylvisorex jsou vzájemně promíchány, což bude vyžadovat detailnější taxonomické revidování. Obdobně je rod Paracrocidura jednoznačně vnitřní linií rodu Crocidura. Jaderná fylogeneze uvnitř rodu Crocidura ukazuje při srovnání s cytB téměř shodnou, avšak plně vyřešenou topologii na úrovni druhových komplexů. Významným rozdílem mezi porovnávanými stromy je pozice komplexu C. maurisca. Rozdílné topologie v rámci jednotlivých komplexů ukazují, které skupiny potřebují taxonomickou revizi za použití morfologických a geografických dat. Vyřešení komplikované taxonomie afrotropických bělozubek umožní lépe kvantifikovat biodiverzitu v subsaharské Africe a nalézt prioritní místa pro její ochranu. |