Informace o publikaci
Indel patterns of the plastid DNA trnL-trnF region within the genus Poa (Poaceae)
| Název česky | Indelové paterny trnL-trnF regionu plastidové DNA v rámci rodu Poa (Poaceae) |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2004 |
| Druh | Článek v odborném periodiku |
| Časopis / Zdroj | Journal of Plant Research |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| www | http://www.springerlink.com/index/10.1007/s10265-004-0172-4 |
| Obor | Botanika |
| Klíčová slova | Indel patterns; infrageneric variability; Poa; Poaceae; trnL intron; trnL-trnF IGS |
| Popis | Pro klasifikaci skupin taxonů z rodu Poa s různými typy plastidových genomů byly použity indely (inzerce/delece) z trnL intronu a trnL-trnF mezigenového spaceru (IGS). V rámci 11 z 13 sekcí rodu Poa prezentovaných ve díle Flora Europaea bylo nově sekvencováno celkem 23 taxonů (P. alpina, P. badensis, P. bulbosa, P. crassipes, P. molinerii, P. annua, P. chaixii, P. granitica, P. pratensis, P. sibirica, P. remota, P. botryoides, P. cenisia, P. compressa, P. laxa, P. margilicola, P. media, P. nemoralis, P. palustris, P. pannonica, P. pirinica, P. riphaea, and P. sejuncta) a dále 18 sekvencí, dostupných z databáze NCBI. Sekvenční paterny indelů, zahrnující méně než 0.7 % plastidového genomu, potvrdily čtyři skupiny taxonů, již dříve vymezené na základě restrikční analýzy celé plastidové DNA. Zjištěné indely byly téměř vždy unikátní pro danou skupinu a nebylo je proto možné využít k posouzení vzájemné příbuznosti skupin. Byly však užitečné pro infragenerickou klasifikaci rodu Poa. |
| Související projekty: |