GC Content in Plant Genomes

• Název česky: GCbsah v rostlinných genomech
• Autoři: BUREŠ Petr; ŠMARDA Petr; HRALOVÁ Ivana; FUNES-SORIANO Sara; LYSÁK Martin; ŘEPKA Radomír; HELÁNOVÁ Klára; ROTREKLOVÁ Olga; PROCHÁZKOVÁ Jana; ÚRADNÍČEK Luboš; KŮROVÁ Jana
• Rok publikování: 2007
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: Analytical Cytometry IV
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Obor: Botanika
• Klíčová slova: Genome size; base composition; Carex; Eleocharis; Festuca; Apiaceae; Brassicaceae; Epilobium; Salix
• Popis: Obsah GC bazí je znakem používáným obecně zejména v taxonomii prokaryot, avšak jeho role v evoluci rostlin zůstává zatím nejasná. S použitím průtokové cytometrie jsme stanovili zastoupení bazí v genomech Apiaceae (16 spp.), Brassicaceae (30 spp.), Cyperaceae (135 spp.), Onagraceae (15 spp.), Poaceae (132 spp.) a Salicaceae (20 spp.). Nalezli jsme v rámci těchto příbuzenských okruhů signifikantní klorelaci mezi velikostí genomu a zastoupením GC bazí.

Související projekty

• Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase
• Centrum pro výzkum biodiverzity