Genomová struktura spirochet rodu Treponema.

• Autoři: ŠMAJS David; MATĚJKOVÁ Petra; STROUHAL Michal; ČEJKOVÁ Darina; ZOBANÍKOVÁ Marie; ŠMARDA Jan
• Rok publikování: 2007
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: 24. Kongres Československé společnosti mikrobiologické.Abstrakty.
• Fakulta / Pracoviště MU: Lékařská fakulta
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Klíčová slova: Genome structure; Treponema; spirochete
• Popis: Byly získány genomové sekvence sedmi zástupců rodu Treponema, t.j. 3 kmenů Treponema pallidum subsp. pallidum (Nichols, SS14, Dal-1), 3 kmenů Treponema pallidum subsp. pertenue (CDC2, Gauthier, Samoa D) a Treponema paraluiscuniculi kmene Cuniculi A. Získané genomové sekvence byly porovnány a nalezené rozdíly byly korelovány s mírou patogenity a invazivity jednotlivých kmenů, poddruhů a druhů. Sekvenční rozdíly mezi genomy stejného poddruhu sloužily pro definování rozsahu genetické variability uvnitř poddruhu a k identifikaci genetických rozdílů odpovědných za odlišnou míru patogenity jednotlivých kmenů. Mezipoddruhové rozdíly pak určovaly různou míru patogenity mezi poddruhy pallidum a pertenue. Mezidruhové rozdíly definovaly rozdíly mezi patogenními a nepatogenními spirochetami. Porovnáním genomů jsme identifikovali variabilní úseky genomů, které mohou sloužit pro molekulární identifikaci jednotlivých kmenů, poddruhů a druhů.

Související projekty

• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
• Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum