Informace o publikaci

Assessment of Microarray Data Correlation Structure Influence on False Discovery Rate Procedures in R.

Název česky Hodnocení vlivu korelační struktury expresních dat na FDR procedury v R
Autoři

PAVLÍK Tomáš SCHIMEK Michael

Rok publikování 2007
Druh Článek ve sborníku
Konference 56th Session of the International Statistical Institute
Fakulta / Pracoviště MU

Lékařská fakulta

Citace
Obor Aplikovaná statistika, operační výzkum
Klíčová slova Microarray Data; False Discovery Rate; Correlation Structure
Popis Vzhledem k počtu správně identifikovaných genů na hladině významnosti 5% jednoznačně dominuje procedura EBT nad procedurami kontrolujícími FDR. Na druhou stranu, EBT procedura vůbec nebere v potaz celkovou míru chyby I. druhu, což znamená, že správně identifikované geny jsou doprovázeny falešně pozitivními výsledky. EBT proceduru tak lze doporučit pro hodnocení genomických dat bez korelační struktury. Oba typy procedur vykazují velmi podobné výsledky na hladině významnosti 10%, zejména při hodnocení korelovaných dat. Na závěr lze konstatovat, že na datech s vysokou mírou komplexity je schopnost procedur EBT a FDR správně identifikovat rozdílně exprimované geny obecně velmi malá.

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info