RNDr. Silvie Trantírková, Ph.D.

2025

• In-cell NMR spectroscopy of nucleic acids: Basic concepts, practical aspects, and applications

  TRANTÍRKOVÁ Silvie HARNOŠ Jakub RYNEŠ Jan ZLÍNSKÁ Vladimíra TRANTÍREK Lukáš

  Článek v odborném periodiku

  Progress in Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy, rok: 2025, ročník: 148-149, vydání: August-October, DOI

• Protein structure and interactions elucidated with in-cell NMR for different cell cycle phases and in 3D human tissue models

  RYNEŠ Jan IŠTVÁNKOVÁ Eva KRAFČÍKOVÁ Michaela LUCHINAT Enrico BARBIERI Letizia BANCI Lucia KAMARÝTOVÁ Kristýna LOJA Tomáš FAFÍLEK Bohumil RICO LLANOS Gustavo KREJČÍ Pavel MACUREK Libor TRANTÍRKOVÁ Silvie TRANTÍREK Lukáš

  Článek v odborném periodiku

  Communications Biology, rok: 2025, ročník: 8, vydání: 1, DOI

• Specific inhibition of fibroblast growth factor receptor 1 signaling by a DNA aptamer

  ZLÍNSKÁ Vladimíra FEKETOVÁ Zuzana CZYREK Aleksandra Anna CHUDZIAN Julia ZIVKOVIC Martina Lenarcic URSACHI Vlad-Constantin DUDEJA Pooja FAFÍLEK Bohumil RYNEŠ Jan RICO LLANOS Gustavo KOUDELKA Adolf ROY Tanaya BIADUN Martyna RAŠKOVÁ Vendula SVOZILOVÁ Kateřina STROBLOVÁ Michaela KRZYSCIK Mateusz HRISTOVA Kalina KROWARSCH Daniel TRANTÍRKOVÁ Silvie ZAKRZEWSKA Malgorzata TRANTÍREK Lukáš KREJČÍ Pavel

  Článek v odborném periodiku

  MOLECULAR THERAPY-NUCLEIC ACIDS, rok: 2025, ročník: 36, vydání: 1, DOI

2024

• A sodium/potassium switch for G4-prone G/C-rich sequences

  LUO Yu LENARČIČ ŽIVKOVIC Martina WANG Jiawei RYNEŠ Jan TRANTÍRKOVÁ Silvie TRANTÍREK Lukáš VERGA Daniela MERGNY Jean-Louis

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: 1, DOI

• In-cell NMR suggests that DNA i-motif levels are strongly depleted in living human cells

  VÍŠKOVÁ Pavlína IŠTVÁNKOVÁ Eva RYNEŠ Jan DŽATKO Šimon LOJA Tomáš LENARČIČ ŽIVKOVIC Martina RIGO Riccardo EL-KHOURY Roberto SERRANO-CHACON Israel DAMHA Masad J GONZALEZ Carlos MERGNY Jean-Louis TRANTÍRKOVÁ Silvie TRANTÍREK Lukáš

  Článek v odborném periodiku

  Nature Communications, rok: 2024, ročník: 15, vydání: 1, DOI

2023

• Nanodiamonds as artificial proteins for regulation of a cell signalling system

  CÍGLER Petr BÁLEK Lukáš HAVLÍK Jan KREJČÍ Pavel TRANTÍREK Lukáš TRANTÍRKOVÁ Silvie

  Patent

  Vydavatel: European Patent Office, stát vydání: Německo, číslo patentu: EP3645018B1, rok: 2023

• Nanodiamonds as artificial proteins for regulation of a cell signalling system

  CÍGLER Petr BÁLEK Lukáš HAVLÍK Jan KREJČÍ Pavel TRANTÍREK Lukáš TRANTÍRKOVÁ Silvie

  Patent

  Vydavatel: United States Patent and Trademark Office, stát vydání: Spojené státy americké, číslo patentu: US11744855B2, rok: 2023

2020

• Composite 5-methylations of cytosines modulate i-motif stability in a sequence-specific manner: Implications for DNA nanotechnology and epigenetic regulation of plant telomeric DNA

  ŠKOLÁKOVÁ Petra BADRI Zahra TRANTÍRKOVÁ Silvie RYNEŠ Jan ŠPONER Jiří FOJTOVÁ Miloslava FAJKUS Jiří MAREK Radek VORLÍČKOVÁ Michaela MERGNY Jean-Louis TRANTÍREK Lukáš

  Článek v odborném periodiku

  BBA - General Subjects, rok: 2020, ročník: 1864, vydání: 9, DOI

• Elucidation of protein interactions necessary for the maintenance of the BCR-ABL signaling complex

  GREGOR Tomáš BOSÁKOVÁ Michaela NITĂ Alexandru POOVAKULATHU ABRAHAM Sara FAFÍLEK Bohumil ČERNOHORSKÁ Nicole RYNEŠ Jan TRANTÍRKOVÁ Silvie ŽÁČKOVÁ Daniela MAYER Jiří TRANTÍREK Lukáš KREJČÍ Pavel

  Článek v odborném periodiku

  Cellular and molecular life sciences, rok: 2020, ročník: 77, vydání: 19, DOI

• In-cell NMR Spectroscopy of Nucleic Acids

  DŽATKO Šimon FIALA Radovan HANSEL-HERTSCH R. TRANTÍRKOVÁ Silvie TRANTÍREK Lukáš

  Článek v odborném periodiku

  IN-CELL NMR SPECTROSCOPY: FROM MOLECULAR SCIENCES TO CELL BIOLOGY, rok: 2020, ročník: 21, vydání: 2020, DOI