prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

2025

• Modulation of Amyloid-β Aggregation by Surface Proteins from Pathogens Associated with Alzheimer's Disease

  KUNKA Antonín HŘÍBKOVÁ Hana VÁŇOVÁ Tereza POSPÍŠILOVÁ Veronika HAVLÁSEK Martin HAVIERNIK Jan RŮŽEK Daniel DAMBORSKÝ Jiří BOHAČIAKOVÁ Dáša PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  ACS Chemical Neuroscience, rok: 2025, ročník: 16, vydání: 18, DOI

• Moldina: a fast and accurate search algorithm for simultaneous docking of multiple ligands

  HALFAR Radek DAMBORSKÝ Jiří MARQUES Sérgio Manuel MARTINOVIC Jan

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Cheminformatics, rok: 2025, ročník: 17, vydání: 1, DOI

• Quantum computing for faster enzyme discovery and engineering

  DAMBORSKÝ Jiří KOUBA Petr SIVIC Josef VAŠINA Michal BEDNÁŘ David MAZURENKO Stanislav

  Článek v odborném periodiku

  Nature Catalysis, rok: 2025, ročník: 8, vydání: 9, DOI

• Structure Prediction and Computational Protein Design for Efficient Biocatalysts and Bioactive Proteins

  BULLER Rebecca DAMBORSKÝ Jiří HILVERT Donald BORNSCHEUER Uwe T.

  Článek v odborném periodiku

  Angewandte Chemie International Edition, rok: 2025, ročník: 64, vydání: 2, DOI

• Thrombolytic proteins profiling: High-throughput activity, selectivity, and resistance assays

  TOUL Martin STRUNGA Alan DAMBORSKÝ Jiří PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  FEBS Open Bio, rok: 2025, DOI

2024

• A computational workflow for analysis of missense mutations in precision oncology

  KHAN Rayyan Tariq POKORNÁ Petra DVORSKÝ Jan BORKO Simeon AREFIEV Ihor PLANAS IGLESIAS Joan DOBIÁŠ Adam RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar SZOTKOWSKÁ Veronika ŠTĚRBA Jaroslav SLABÝ Ondřej DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  JOURNAL OF CHEMINFORMATICS, rok: 2024, ročník: 16, vydání: 1, DOI

• AggreProt: a web server for predicting and engineering aggregation prone regions in proteins

  PLANAS IGLESIAS Joan BORKO Simeon SWIATKOWSKI Jan ELIAS Matej HAVLÁSEK Martin SALAMON Ondrej GRAKOVA Ekaterina KUNKA Antonín MARTINOVIC Tomas DAMBORSKÝ Jiří MARTINOVIC Jan BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: W1, DOI

• Analysis of mutations in precision oncology using the automated, accurate, and user-friendly web tool PredictONCO

  KHAN Rayyan Tariq POKORNÁ Petra DVORSKÝ Jan BORKO Simeon DOBIÁŠ Adam PLANAS IGLESIAS Joan MAZURENKO Stanislav AREFIEV Ihor RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar SZOTKOWSKÁ Veronika ŠTĚRBA Jaroslav DAMBORSKÝ Jiří SLABÝ Ondřej BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2024, ročník: 24, vydání: December 2024, DOI

• Azobenzene-Based Photoswitchable Substrates for Advanced Mechanistic Studies of Model Haloalkane Dehalogenase Enzyme Family

  SLÁNSKÁ Michaela ŠTACKOVÁ Lenka MARQUES Sérgio Manuel ŠTACKO Peter MARTÍNEK Marek JÍLEK Luboš TOUL Martin DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David KLÁN Petr PROKOP Zbyněk

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2024, ročník: 14, vydání: 15, DOI

• Bacterial Lactonases ZenA with Noncanonical Structural Features Hydrolyze the Mycotoxin Zearalenone

  FRUHAUF Sebastian PUHRINGER Dominic THAMHESL Michaela FAJTL Patricia KUNZ-VEKIRU Elisavet HOBARTNER-GUSSL Andreas SCHATZMAYR Gerd ADAM Gerhard DAMBORSKÝ Jiří DJINOVIC-CARUGO Kristina PROKOP Zbyněk MOLL Wulf-Dieter

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2024, ročník: 14, vydání: 5, DOI