prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

2024

• Large-scale annotation of biochemically relevant pockets and tunnels in cognate enzyme-ligand complexes

  VÁVRA Ondřej TYZACK J. HADDADI Faraneh DVORSKÝ Jan DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav THORNTON J.M. BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Cheminformatics, rok: 2024, ročník: 16, vydání: 1, DOI

• Learning to design protein-protein interactions with enhanced generalization

  BUSHUIEV Anton BUSHUIEV Roman KOUBA Petr FILKIN Anatolii GABRIELOVA Marketa GABRIEL Michal SEDLAR Jiri PLUSKAL4 Tomas DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav SIVIC Josef

  Článek ve sborníku

  12th International Conference on Learning Representations 2024, rok: 2024

• Nová duální dehalogenáza-luciferáza z hvězdice křehké Amphiura filiformis

  MAJEROVÁ Marika VAŠINA Michal PLUSKAL Daniel SEDLÁČKOVÁ Karolina PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří MAREK Martin

  Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek)

  Rok: 2024

• Nová vysoce aktivní luciferáza z hvězdice křehké Amphiura filiformis

  MAJEROVÁ Marika VAŠINA Michal PLUSKAL Daniel SEDLÁČKOVÁ Karolina PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří MAREK Martin

  Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek)

  Rok: 2024

• PredictONCO: a web tool supporting decision-making in precision oncology by extending the bioinformatics predictions with advanced computing and machine learning

  ŠTOURAČ Jan BORKO Simeon KHAN Rayyan Tariq POKORNÁ Petra DOBIÁŠ Adam PLANAS IGLESIAS Joan MAZURENKO Stanislav RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar SZOTKOWSKÁ Veronika ŠTĚRBA Jaroslav SLABÝ Ondřej DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  Briefings in Bioinformatics, rok: 2024, ročník: 25, vydání: 1, DOI

• Revealing data leakage in protein interaction benchmarks

  BUSHUIEV Anton BUSHUIEV Roman SEDLAR Jiri PLUSKAL Tomas DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav SIVIC Josef

  Článek ve sborníku

  ICLR 2024 Workshop on Generative and Experimental Perspectives for Biomolecular Design, rok: 2024

• Structural analysis of the stable form of fibroblast growth factor 2 - FGF2-STAB

  DE LA BOURDONNAYE Gabin MAREK Martin GHAZALOVÁ Tereza DAMBORSKÝ Jiří PACHL Petr BRYNDA Jiri ŠTĚPÁNKOVÁ Veronika CHALOUPKOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Structural Biology: X, rok: 2024, ročník: 10, vydání: December 2024, DOI

• Successor Sequence Predictor (SSP)

  KHAN Rayyan Tariq KOHOUT Pavel MUSIL Miloš ROSÍNSKÁ Monika DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav BEDNÁŘ David VILÍM Jan

  Software

  Rok: 2024

• Upravená dehalogenáza LinB116 se zlepšenou termostabilitou

  HAVLÁSEK Martin DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Technicky realizované výsledky (prototyp, funkční vzorek)

  Rok: 2024

• Variační nástroj založený na autoenkodéru pro návrh ancestrálních proteinů

  KOHOUT Pavel DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Software

  Rok: 2024