doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.

2019

• Automated family-wide annotation of secondary structure elements

  MIDLIK Adam HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ Ivana HUTAŘ Jan MOTURU Tarakaramji NAVRÁTILOVÁ Veronika KOČA Jaroslav BERKA Karel SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka

  Kapitola v knize

  Protein supersecondary structures: Methods and protocols, vydání: Vyd. Second Edition, rok: 2019, počet stran: 25 s.

• Creation and visualization of secondary structure consensus for protein families

  MIDLIK Adam HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ Ivana HUTAŘ Jan NAVRÁTILOVÁ Veronika KOČA Jaroslav BERKA Karel SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2019, druh: Další prezentace na konferencích

• Exploring trends in quality and features of biomacromolecular complexes with ValTrendsDB

  HORSKÝ Vladimír BENDOVÁ Veronika TOUŠEK Dominik KOČA Jaroslav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty

• Interactive exploration of trends in biomacromolecule structure quality with ValTrendsDB

  HORSKÝ Vladimír BENDOVÁ Veronika TOUŠEK Dominik SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty

• Partial atomic charges for proteins

  SCHINDLER Ondřej RAČEK Tomáš SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty

• Protein Data Bank: the single global archive for 3D macromolecular structure data

  BURLEY S.K. BERMAN H.M. BHIKADIYA C. BI C.X. CHEN L. DI COSTANZO L. CHRISTIE C. DUARTE J.M. DUTTA S. FENG Z.K. GHOSH S. GOODSELL D.S. GREEN R.K. GURANOVIC V. GUZENKO D. HUDSON B.P. LIANG Y.H. LOWE R. PEISACH E. PERISKOVA I. RANDLE C. ROSE A. SEKHARAN M. SHAO CH. TAO Y.P. VALASATAVA Y. VOIGT M. WESTBROOK J. YOUNG J. ZARDECKI C. ZHURAVLEVA M. KURISU G. NAKAMURA H. KENGAKU Y. CHO H. SATO J. KIM J.Y. IKEGAWA Y. NAKAGAWA A. YAMASHITA R. KUDOU T. BEKKER G.J. SUZUKI H. IWATA T. YOKOCHI M. KOBAYASHI N. FUJIWARA T. VELANKAR S. KLEYWEGT G.J. ANYANGO S. ARMSTRONG D.R. BERRISFORD J.M. CONROY M.J. DANA J.M. DESHPANDE M. GANE P. GÁBOROVÁ Romana GUPTA D. GUTMANAS A. KOČA Jaroslav MAK L. MIR S. MUKHOPADHYAY A. NADZIRIN N. NAIR S. PATWARDHAN A. PAYSAN-LAFOSSE T. PRAVDA Lukáš SALIH O. SEHNAL David VARADI M. SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka MARKLEY J.L. HOCH J.C. ROMERO P.R. BASKARAN K. MAZIUK D. ULRICH E.L. WEDELL J.R. YAO H.Y. LIVNY M. IOANNIDIS Y.E.

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2019, ročník: 47, vydání: D1, DOI

• The bio.tools registry of software tools and data resources for the life sciences

  ISON Jon IENASESCU Hans CHMURA Piotr RYDZA Emil MÉNAGER Hervé KALAŠ Matúš SCHWÄMMLE Veit GRÜNING Björn BEARD Niall LOPEZ Rodrigo DUVAUD Severine STOCKINGER Heinz PERSSON Bengt SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka RAČEK Tomáš VONDRÁŠEK Jiří PETERSON Hedi SALUMETS Ahto JONASSEN Inge HOOFT Rob NYRÖNEN Tommi VALENCIA Alfonso CAPELLA Salvador GELPÍ Josep ZAMBELLI Federico SAVAKIS Babis LESKOŠEK Brane RAPACKI Kristoffer BLANCHET Christophe JIMENEZ Rafael OLIVEIRA Arlindo VRIEND Gert COLLIN Olivier HELDEN Jacques van LONGREEN Peter BRUNAK Soren

  Článek v odborném periodiku

  GENOME BIOLOGY, rok: 2019, ročník: 20, vydání: 164, DOI

• ValTrendsDB: bringing Protein Data Bank validation information closer to the user

  HORSKÝ Vladimír BENDOVÁ Veronika TOUŠEK Dominik KOČA Jaroslav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2019, ročník: 35, vydání: 24, DOI

• ValTrendsDB: bringing Protein Data Bank validation information closer to the user

  HORSKÝ Vladimír SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka BENDOVÁ Veronika TOUŠEK Dominik KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty

• ValTrendsDB: Database of biomacromolecular structure validation trends

  HORSKÝ Vladimír BENDOVÁ Veronika TOUŠEK Dominik KOČA Jaroslav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka

  Software

  Rok: 2019