Mgr. David Procházka

odborný pracovník ve výzkumu – Katedra strojového učení a zpracování dat
odborný pracovník ve výzkumu – Katedra počítačových systémů a komunikací

kancelář: B419
Botanická 554/68a
602 00 Brno

Zobrazit na mapě

telefon:	549 49 6930
e‑mail:

sociální a akademické sítě:

Základní údaje

Životopis

Školitel

Kvalifikace

Publikace

Druh

Počet publikací: 19

2024

AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome – data and model

NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš GREŠOVÁ Katarína OĽHA Jaroslav DOHNAL Vlastislav ROŠINEC Adrián ANTOL Matej

Specializovaná databáze

Rok: 2024, druh: Specializovaná databáze
AlphaFind: discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

PROCHÁZKA David SLANINÁKOVÁ Terézia OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

Článek v odborném periodiku

Nucleic acids research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: W1, DOI
Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository

SLANINÁKOVÁ Terézia GREŠOVÁ Katarína PROCHÁZKA David SPIŠAKOVÁ Viktória ROŠINEC Adrián ČILLÍK Jakub ŠPRINGEROVÁ Pavlína KŘENEK Aleš DOHNAL Vlastislav SVOBODOVÁ Radka ANTOL Matej

Konferenční abstrakty

Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty
GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

Projekty výzkumu a vývoje

Rok: 2024, druh: Projekty výzkumu a vývoje
Learned Metric Index

SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David

Software

Rok: 2024
LMI-10: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

Projekty výzkumu a vývoje

Rok: 2024, druh: Projekty výzkumu a vývoje
LMI-30: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

Projekty výzkumu a vývoje

Rok: 2024, druh: Projekty výzkumu a vývoje

2023

SISAP 2023 Indexing Challenge – Learned Metric Index

SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David ANTOL Matej OĽHA Jaroslav DOHNAL Vlastislav

Článek ve sborníku

Similarity Search and Applications. SISAP 2023. Lecture Notes in Computer Science, vol 14289, rok: 2023

2021

Organizing Similarity Spaces using Metric Hulls

JÁNOŠOVÁ Miriama PROCHÁZKA David DOHNAL Vlastislav

Článek ve sborníku

14th International Conference on Similarity Search and Applications (SISAP 2021), rok: 2021

Projekty

Výuka

Studijní programy

Přijímačky a TSP

Přečtěte si o výzkumu na MU

Mgr. David Procházka

2024

AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome – data and model

AlphaFind: discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository

GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

Learned Metric Index

LMI-10: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

LMI-30: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

2023

SISAP 2023 Indexing Challenge – Learned Metric Index

2021

Organizing Similarity Spaces using Metric Hulls