Informace o projektu

Studium kódu CTD RNA polymerázy II

Logo poskytovatele
Kód projektu
GA13-18344S (kod CEP: GA13-18344S)
Období řešení
1/2013 - 12/2017
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
Fakulta / Pracoviště MU
Středoevropský technologický institut

Navrhuji objasnit základní pravidla, která používají RNA procesující faktory pro rozpoznávání tzv. CTD kódu RNA polymerázy II. Koncept CTD kódu, který urcuje pozici RNA polymerázy v transkripcním cyklu a rídí interakce se specifickými procesujícími
faktory byl navrhnut témer pred 10 lety. Snaha odhalit strukturu CTD a její interakce s cetnými vazebnými faktory byla neúspešná v predchozích krystalografických pokusech z duvodu flexibility CTD a její slabé vazebné afinite k procesujícím
faktorum. V tomto projektu urcíme NMR struktury nekolika procesujících faktoru navázaných na CTD s ruznými modifikacními znackami. Nedávný vývoj v oblasti SAXS technik, které lze nyní kombinovat s vysoce rozlišenými NMR strukturami, nám umožní
objasnit dlouhodobou otázku jak vazba procesujících faktoru mení strukturu CTD. Použití této technologie poskytne zcela nové strukturní informace k objasnení CTD kódu, což významne posune hranice poznání v oboru transkripce a procesování RNA.

Publikace

Počet publikací: 3