Informace o projektu
Chromatin asociované faktory podílející se na regulaci 45SrDNA v Arabidopsis
- Kód projektu
- GJ16-04166Y (kod CEP: GJ16-04166Y)
- Období řešení
- 1/2016 - 12/2018
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Juniorské granty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
Arabidopsis 45SrDNA je lokalizována na chromozomu 2 a 4. Existují minimálně 4 různé varianty 45SrDNA,
které se exprimují v závislosti na stadiu vývoje rostliny. Stabilita 45SrDNA je narušena u fas mutantů (
mutantů pro podjednotky chromatin assembly faktoru CAF1), u nichž se 45SrDNA systematicky ztrácí.
Dle našich předběžných dat, tento efekt není možno zcela revertovat, ani po dlouhodobé propagaci
rostlin ve WT genetickém pozadí. Kromě ztráty 45SrDNA dochází u fas mutantů ke stimulaci genů, které
se účastní oprav DNA. 45SrDNA je také regulována epigeneticky nebo pomocí proteinů účastnících se
homologní rekombinace. Cílem tohoto projektu bude dále rozšířit znalosti v oblasti udržování stability
45SrDNA. Budou analyzovány epigenetické změny u rostlin po reverzi z fas mutace, příspěvek vybraných
chaperonů a kináz aktivovaných poškozením DNA k udržení stability 45SrDNA a rozložení H3 histonových variant v 45SrDNA lokusu.
Publikace
Počet publikací: 4
2018
-
Replication of ribosomal DNA in Arabidopsis occurs both inside and outside the nucleolus during S phase progression
Journal of Cell Science, rok: 2018, ročník: 131, vydání: 2, DOI
-
Visualization of the Nucleolus Using Ethynyl Uridine.
Frontiers in Plant Science, rok: 2018, ročník: 9, vydání: FEB, DOI
2016
-
Phenotypic reversion in fas mutants of Arabidopsis thaliana by reintroduction of FAS genes: variable recovery of telomeres with major spatial rearrangements and transcriptional reprogramming of 45S rDNA genes
Plant Journal, rok: 2016, ročník: 88, vydání: 3, DOI
-
Variation of 45S rDNA intergenic spacers in Arabidopsis thaliana
Plant Molecular Biology, rok: 2016, ročník: 92, vydání: 4-5, DOI