Charakteristika dynamické struktury a interakcí PG domény karbonát anhydrázy IX s ohledem na inhibici
- Kód projektu
- MUNI/C/0003/2022
- Období řešení
- 3/2022 - 2/2023
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Masarykova univerzita
- Grantová agentura MU
- Podpora vynikajících diplomových prací
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- Vojtěch Vařečka
Pevné nádory patří k nejčastěším typům rakovinného bujení lidských buněk. Pro jejich vznik a rozvoj jsou charakteristické specifické změny buněčného metabolismu, zejména zvýšení glykolýzy na úkor oxidativních procesů. Tento jev ovšem vede k výraznému okyselení prostředí, se kterým se nádorové buňky musí vyrovnat. Klíčovou roli v této životně důležité adaptaci hraje karbonát anhydráza IX (CA IX). Výskyt CA IX je ve zdravém lidském těle značně omezený, naopak v rámci pevných nádorů je nalézána zcela běžně a bývá spojována s pokročilími stádii onemocnění a špatnou prognózou. Celkově se tedy jedná o vhodný cíl pro vývoj chemoterapeutik. Tento je však komplikován strukturní podobností katalytické domény napříč izoformami karbonát anhydrázy, z nichž některé hrají významnou roli v metabolismu mnoha tkání, jakož i obtížností přípravy tohoto proteinu. Cílem této práce je tedy řešení nastíněného problému pomocí metod výpočetní chemie a návrh účinného, selektivního inhibitoru CA IX. Předpokládá se aplikace molekulárního dokování a především různých specializovaných metod molekulové dynamiky.