Lidské buňky jsou schopné exprimovat 35 různých MAGE (Melanoma antigen) proteinů. MAGEG1-Nse1 heterodimer je součástí Smc5-6 komplexu, který se účastní opravy poškozené DNA. Kromě Nse1, který obsahuje RING-finger E3 ubiquitin ligasovou doménu, existují další dva příklady MAGE-RING finger interakcí. Pokus o predikci struktury MAGE homologní domény (MHD) naznačil její částečnou podobnost s doménou molekuly cullinu, který tvoří E3 ubiquitin ligasový komplex. V tomto projektu chceme ověřit hypotézu: "MAGE proteiny slouží jako kofaktory E3 RING ubiquitin ligás." Budeme mutovat konzervované aminokyselinové zbytky MAGEG1 proteinu tak, abychom zjistili, které z nich se podílí na interakci s Nse1. U specifických mutant budeme sledovat schopnost komplexu Smc5-6 učastnit se opravy DNA. Najdeme další RING finger proteiny a podrobíme je podobné analýze s cílem charakterizovat obecné interakční vlastnosti MAGE proteinů. Strukturu MHD budeme studovat pomocí NMR spektroskopie a difrakce krystalů.

Publikace