Informace o publikaci
CAVER Viewer-new tool enhancing computation and visualization of channels in proteins
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2010 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | The IADIS Computer Graphics, Visualization, Computer Vision and Image Processing (CGVCVIP) 2010 |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Informatika |
| Klíčová slova | CAVER; CAVER Viewer; visualization; protein; channel; molecular dynamics |
| Popis | Tento článek popisuje možnosti aplikace CAVER Viewer, která se věnuje analýze a vizualizaci proteinových struktur. Právě díky specifické tvoří doplněk k již existujícím programům věnujícím se proteiovým strukturám. CAVER Viewer poskytuje rozhraní pro výpočet a analýzu tzv. tunelů v proteinech a zároveň obsahuje sadu tradičních i nových technik pro vizualizaci výsledků. Specifické struktury, které zkoumáme, jsou nazývany tunely. Jejich prozkoumání je umožněno spojením 3D zobrazení a dvoudimenzionální informace o tunelech v podobě grafových statistik. V porovnání s existujícími aplikacemi CAVER Viewer zpracovává rozsáhlé množiny dat reprezentující molekulovou dynamiku - pohyb a chování proteinu v čase. |
| Související projekty: |