Informace o projektu

Vizualice proteinových struktur

Logo poskytovatele
Kód projektu
GA201/07/0927
Období řešení
1/2007 - 12/2009
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
Fakulta / Pracoviště MU
Fakulta informatiky
Další fakulta/pracoviště MU
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova
virtuální realita, vizualizace proteinu, interakční techniky, molekulová dynamika

Projekt je zaměřen na výzkum metod pro vizualizaci proteinů. Pomocí metod počítačové geometrie jsou analyzovány prostorové vztahy v proteinových strukturách a vyhledávány tunely, které mají výrazný vliv na reaktivní schopnosti proteinu. Pro analýzu rozsáhlých proteinů jsou využity 3D Voroného diagramy. Je řešena identifikace významných tunelů a jejich vývoj v časovém intervalu. Projekt také řeší nové metody vizualizace pomocí prostředků virtuální reality, které zviditelní detaily analýzy proteinu. Pro proteiny s vysokou složitostí bude vyvinuta metoda významem řízené vizualizace.
Další část projektu se zaměří na interaktivní modifikaci proteinové struktury ve zvolených oblastech tunelů pomocí výměny reziduí a jejich rotamerů. Zde budou aplikovány metody počítačové geometrie spolu s kombinatorickými přístupy. Současně bude nutné řešit problematiku detekce kolizí mezi atomickými strukturami. Kromě základního výzkumu bude výsledkem projektu interaktivní aplikace pro proteinové inženýrství.

Publikace

Počet publikací: 23


Předchozí 1 2 3 Další

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info