Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.

2023

• Cloudification of scientific experimental data using Onedata

  SVOBODA Tomáš KŘENEK Aleš OPIOŁA Łukasz MANZI Andrea HANDL Josef

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty

• Enhancing Data Accessibility: Strategies and Tools for Effective Metadata Management

  ROŠINEC Adrián SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš KŘENEK Aleš SVOBODOVÁ Radka

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2023, druh: Další prezentace na konferencích

• Introduction to Onedata at CEITEC MU and in Czech National Repository Platform

  SVOBODA Tomáš SVOBODOVÁ Radka ANTOŠ David ROŠINEC Adrián KŘENEK Aleš

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2023, druh: Další prezentace na konferencích

• Onedata4Sci: Life-science experimental datasets management system

  ROŠINEC Adrián SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš HANDL Josef SABO Jozef KŘENEK Aleš SVOBODOVÁ Radka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty

• αCharges: partial atomic charges for AlphaFold structures in high quality

  SCHINDLER Ondřej BERKA Karel CANTARA Alessio KŘENEK Aleš TICHÝ Dominik RAČEK Tomáš SVOBODOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2023, ročník: 51, vydání: W1, DOI

2022

• Automatic storing, sharing and archiving datasets with Onedata

  SVOBODA Tomáš KŘENEK Aleš HANDL Josef

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2022, druh: Další prezentace na konferencích

• Automating scientific dataset management and processing using Onedata

  SVOBODA Tomáš KŘENEK Aleš HANDL Josef

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2022, druh: Další prezentace na konferencích

• Collective Variable for Metadynamics Derived From AlphaFold Output

  SPIWOK Vojtěch KUREČKA Martin KŘENEK Aleš

  Článek v odborném periodiku

  FRONTIERS IN MOLECULAR BIOSCIENCES, rok: 2022, ročník: 2022, vydání: 9, DOI

• Property Map Collective Variable as a Useful Tool for a Force Field Correction

  TRAPL Dalibor KRUPIČKA MArtin VIŠŇOVSKÝ Vladimír HOZZOVÁ Jana OĽHA Jaroslav KŘENEK Aleš SPIWOK Vojtěch

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Chemical Information and Modeling, rok: 2022, ročník: 62, vydání: 3, DOI

• The EurOPDX Data Portal: an open platform for patient-derived cancer xenograft data sharing and visualization

  DUDOVÁ Zdenka CONTE Nathalie MASON Jeremy STUCHLÍK Dalibor PEŠA Radim HALMAGYI Csaba PEROVA Zinaida MOSAKU Abayomi THORNE Ross FOLLETTE Alex PIVARČ Ľuboslav ŠAŠINKA Radim USMAN Muhammad NEUHAUSER Steven BEGLEY Dale A KRUPKE Debra M FRASSA Massimiliano FIORI Alessandro CORSI Riccardo VEZZADINI Luca ISELLA Claudio BERTOTTI Andrea BULT Carol PARKINSON Helen MEDICO Enzo MEEHAN Terrence KŘENEK Aleš

  Článek v odborném periodiku

  BMC Genomics, rok: 2022, ročník: 23, vydání: 1, DOI