Informace o projektu
Česká národní infrastruktura pro biologická data
(ELIXIR-CZ)
- Kód projektu
- LM2018131
- Období řešení
- 1/2020 - 12/2022
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Další fakulta/pracoviště MU
-
Ústav výpočetní techniky
- prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc.
- RNDr. Matej Antol, Ph.D.
- Mgr. Adam Bodnár
- Ing. Radoslav Čerhák
- Mgr. Ivana Křenková
- Mgr. Slávek Licehammer
- prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc.
- Mgr. Zdeněk Salvet
- WWW stránky projektu
- https://www.elixir-czech.cz/
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba RNDr. Jiří Vondrášek, CSc.
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Univerzita Karlova v Praze
Univerzita Palackého v Olomouci
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze
Západočeská univerzita v Plzni
České vysoké učení technické v Praze
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Biotechnologický ústav AV ČR, v.v.i.
It is a current global trend that life science experiments generate an immense and steadily increasing volume of data. The Czech Republic feels this trend very strongly, because several new life science infrastructures were successfully established here, and they produce large amounts of data. It is necessary to store the data, safely manipulate with them, efficiently extract key information, etc. ELIXIR CZ is an infrastructure which is prepared to accept this challenge.
Thus, ELIXIR CZ aims to create a sustainable infrastructure for storing, processing and analysis of life science data in the Czech Republic. It will also provide tools and training that will facilitate performing these activities. Currently, ELIXIR CZ involves thirteen institutions - nine life science research centres and two IT infrastructures. ELIXIR CZ also creates a communication platform for life science research institutes in the Czech Republic. ELIXIR CZ is a node of the European ESFRI project ELIXIR and is strongly involved in its activities. The ELIXIR project was approved by the Competitiveness Council from ESFRI as one of three prioritised Research Infrastructures.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 54
2022
-
Sex chromosome differentiation via changes in the Y chromosome repeat landscape in African annual killifishes Nothobranchius furzeri and N. kadleci
Chromosome Research, rok: 2022, ročník: 30, vydání: 4, DOI
-
SoluProtMutDB: A manually curated database of protein solubility changes upon mutations
Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2022, ročník: 20, vydání: November 2022, DOI
-
Structural and functional basis of mammalian microRNA biogenesis by Dicer
Molecular Cell, rok: 2022, ročník: 82, vydání: 21, DOI
-
Structural Insights into (Tere)phthalate-Ester Hydrolysis by a Carboxylesterase and Its Role in Promoting PET Depolymerization
ACS Catalysis, rok: 2022, ročník: 12, vydání: 24, DOI
-
Tools for computational design and high-throughput screening of therapeutic enzymes
ADVANCED DRUG DELIVERY REVIEWS, rok: 2022, ročník: 183, vydání: April 2022, DOI
-
Towards a monophyletic classification of Cardueae: restoration of the genus Lophiolepis (= Cirsium p.p.) and new circumscription of Epitrachys
Plant Biosystems, rok: 2022, ročník: 156, vydání: 5, DOI
-
Transcriptomic and proteomic profiling of peptidase expression in Fasciola hepatica eggs developing at host's body temperature
SCIENTIFIC REPORTS, rok: 2022, ročník: 12, vydání: 1, DOI
2021
-
2DProts: database of family-wide protein secondary structure diagrams
Bioinformatics, rok: 2021, ročník: 37, vydání: 23, DOI
-
CATH: increased structural coverage of functional space
Nucleic Acids Research, rok: 2021, ročník: 49, vydání: D1, DOI
-
Development of 48-condition buffer screen for protein stability assessment
European Biophysics Journal With Biophysics Letters, rok: 2021, ročník: 50, vydání: 3-4, DOI