Informace o publikaci

ARResT/Interrogate: an interactive immunoprofiler for IG/TR NGS data

Autoři

BYSTRÝ Vojtěch REIGL Tomáš KREJČÍ Adam DEMKO Martin HANÁKOVÁ Barbora GRIONI Andrea KNECHT Henrik SCHLITT Max DREGER Peter SELLNER Leopold HERRMANN Dietrich PINGEON Marine BOUDJOGHRA Myriam RIJNTJES Jos POTT Christiane LANGERAK Anton W. GROENEN Patricia J. T. A. DAVI Frederic BRUGGEMANN Monika DARZENTAS Nikos

Rok publikování 2017
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Bioinformatics
Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

Citace
www https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/33/3/435/2580414/ARResT-Interrogate-an-interactive-immunoprofiler?redirectedFrom=fulltext
Doi http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btw634
Obor Biochemie
Klíčová slova REPERTOIRE
Popis Motivation: The study of immunoglobulins and T cell receptors using next-generation sequencing has finally allowed exploring immune repertoires and responses in their immense variability and complexity. Unsurprisingly, their analysis and interpretation is a highly convoluted task. Results: We thus implemented ARResT/Interrogate, a web-based, interactive application. It can organize and filter large amounts of immunogenetic data by numerous criteria, calculate several relevant statistics, and present results in the form of multiple interconnected visualizations.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info