Biomarker discovery - Detection of minor protein concentration changes using ICPL protein labeling and 2D GE

• Název česky: Objev biomarkeru - Detekce minimálních změn v proteinových koncentracích s využitím ICPL proteinového značení a 2D GE
• Autoři: POTĚŠIL David; ROČŇOVÁ Ludmila; ČEJKOVÁ Soňa; TRBUŠEK Martin; ZDRÁHAL Zbyněk; HAVLIŠ Jan
• Rok publikování: 2009
• Druh: Prezentace v oblasti VaV (AV tvorba, WEB aplikace apod.)
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Popis: Stanovení nízkých kvantitativních změn v proteinové expresy je stále nesnadný úkol. Důvodem je mimo jiné variabilita vnesená při přípravě vzorku. Byly provedeny 2D GE experimenty, kde byla testována variabilita v proteinových spotech vnesená v průběhu buněčné lyze. Procenta kvalitativně a kvantitativně rozdílných spotů byla okolo 0,5 % a 2,5 %. Ke stanovení poměru koncentrací proteinů ve dvou vzorcích bylo použito ICPL značení. Bylo zjištěno, že jde o přesnou metodu (RSD přibližně 5 %) a výsledky získané po různém zpracováním vzorku jsou porovnatelné.

Související projekty

• Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Senzitivizace B-CLL buněk na cytostatika prostřednictvím monoklonální protilátky rituximab - identifikace zodpovědných proteinů