Informace o publikaci

Metodologie stanovení variability alel MHC genů u ryb čeledi Cyprinidae

Autoři

CIVÁŇOVÁ Kristína VETEŠNÍKOVÁ ŠIMKOVÁ Andrea HEJLOVÁ Kristýna MARTIN Jean-Francois

Rok publikování 2011
Druh Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Popis K analýze variability exprimovaných genů DAB1 a DAB3 u kaprovitých ryb jsme použili 2 metody. První metoda zahrnuje SSCP analýzu, klonování PCR amplikonů, a automatické sekvenování. Jako druhou jsme optimalizovali přípravu vzorků pro „klonální“ sekvenování druhé generace (NGS – next generation sequencing) s využitím technologie 454 pyrosekvenování. V příspěvku srovnáváme klady a zápory námi používaných metod testování.
Související projekty: