Česká národní infrastruktura pro biologická data (ELIXIR-CZ)
- Kód projektu
- LM2015047
- Období řešení
- 1/2016 - 12/2019
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- Mgr. Martin Prokop, Ph.D.
- RNDr. Tomáš Raček, Ph.D.
- RNDr. David Sehnal, Ph.D.
- doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
- Další fakulta/pracoviště MU
- Ústav výpočetní techniky
- WWW stránky projektu
- https://www.elixir-czech.cz/
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba RNDr. Jiří Vondrášek, CSc.
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Univerzita Karlova v Praze
Univerzita Palackého v Olomouci
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Biotechnologický ústav AV ČR, v.v.i.
It is a current global trend that life science experiments generate an immense and steadily increasing volume of data. The Czech Republic feels this trend very strongly, because several new life science infrastructures were successfully established here, and they produce large amounts of data. It is necessary to store the data, safely manipulate with them, efficiently extract key information, etc. ELIXIR CZ is an infrastructure which is prepared to accept this challenge.
Thus, ELIXIR CZ aims to create a sustainable infrastructure for storing, processing and analysis of life science data in the Czech Republic. It will also provide tools and training that will facilitate performing these activities. Currently, ELIXIR CZ involves eleven institutions - nine life science research centres and two IT infrastructures. ELIXIR CZ also creates a communication platform for life science research institutes in the Czech Republic. ELIXIR CZ is a node of the European ESFRI project ELIXIR and is strongly involved in its activities. The ELIXIR project was approved by the Competitiveness Council from ESFRI as one of three prioritised Research Infrastructures.
Publikace
Počet publikací: 68
2018
-
Haloalkane Dehalogenases From Marine Organisms
MARINE ENZYMES AND SPECIALIZED METABOLISM, PT B, rok: 2018, ročník: 605, vydání: 1, DOI
-
HotSpot Wizard 3.0: web server for automated design of mutations and smart libraries based on sequence input information
Nucleic Acids Research, rok: 2018, ročník: 46, vydání: W1, DOI
-
ChannelsDB: database of biomacromolecular tunnels and pores
Nucleic Acids Research, rok: 2018, ročník: 46, vydání: D1, DOI
-
Impact of the access tunnel engineering on catalysis is strictly ligand-specific
the FEBS Journal, rok: 2018, ročník: 285/2018, vydání: 8, DOI
-
INTENSITYANALYSER: WEB TOOL FOR ASSESSMENT OF TELOMERE LENGTHS FROM TERMINAL RESTRICTION FRAGMENT ANALYSIS
15th International Interdisciplinary Meeting on Bioanalysis, rok: 2018
-
Molecular Gating of an Engineered Enzyme Captured in Real Time
Journal of the American Chemical Society, rok: 2018, ročník: 140, vydání: 51, DOI
-
MOLEonline: a web-based tool for analyzing channels, tunnels and pores (2018 update)
Nucleic Acids Research, rok: 2018, ročník: 46, vydání: W1, DOI
-
Validation of ligands in macromolecular structures determined by X-ray crystallography
Acta Crystallographica Section D, rok: 2018, ročník: 74, vydání: 3, DOI
-
Worldwide Protein Data Bank validation information: usage and trends
Acta Crystallographica Section D, rok: 2018, ročník: 74, vydání: MAR, DOI
2017
-
ALK5 kinase inhibitory activity and synthesis of 2,3,4-substituted 5,5-dimethyl-5,6-dihydro-4H-pyrrolo[1,2-b]pyrazoles
European Journal of Medicinal Chemistry, rok: 2017, ročník: 2017, vydání: 127, DOI