Česká národní infrastruktura pro biologická data (ELIXIR-CZ)
- Kód projektu
- LM2015047
- Období řešení
- 1/2016 - 12/2019
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Další fakulta/pracoviště MU
- Ústav výpočetní techniky
- WWW stránky projektu
- https://www.elixir-czech.cz/
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba RNDr. Jiří Vondrášek, CSc.
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Univerzita Karlova v Praze
Univerzita Palackého v Olomouci
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Biotechnologický ústav AV ČR, v.v.i.
It is a current global trend that life science experiments generate an immense and steadily increasing volume of data. The Czech Republic feels this trend very strongly, because several new life science infrastructures were successfully established here, and they produce large amounts of data. It is necessary to store the data, safely manipulate with them, efficiently extract key information, etc. ELIXIR CZ is an infrastructure which is prepared to accept this challenge.
Thus, ELIXIR CZ aims to create a sustainable infrastructure for storing, processing and analysis of life science data in the Czech Republic. It will also provide tools and training that will facilitate performing these activities. Currently, ELIXIR CZ involves eleven institutions - nine life science research centres and two IT infrastructures. ELIXIR CZ also creates a communication platform for life science research institutes in the Czech Republic. ELIXIR CZ is a node of the European ESFRI project ELIXIR and is strongly involved in its activities. The ELIXIR project was approved by the Competitiveness Council from ESFRI as one of three prioritised Research Infrastructures.
Publikace
Počet publikací: 58
2017
-
Ancestral Haloalkane Dehalogenases Show Robustness and Unique Substrate Specificity
CHEMBIOCHEM, rok: 2017, ročník: 18, vydání: 14, DOI
-
Catalytic Cycle of Haloalkane Dehalogenases Toward Unnatural Substrates Explored by Computational Modeling
JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, rok: 2017, ročník: 57, vydání: 8, DOI
-
Computational Analysis of Protein Tunnels and Channels
PROTEIN ENGINEERING. METHODS AND PROTOCOLS, rok: 2017, počet stran: 18 s.
-
LiteMol suite: interactive web-based visualization of large-scale macromolecular structure data
Nature Methods, rok: 2017, ročník: 14, vydání: 12, DOI
-
Metagenome-derived Haloalkane Dehalogenases with Novel Catalytic Properties
APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, rok: 2017, ročník: 101, vydání: 16, DOI
-
Structure-function Relationships and Engineering of Haloalkane Dehalogenases.
HANDBOOK OF HYDROCARBON AND LIPID MICROBIOLOGY SERIES. AEROBIC UTILIZATION OF HYDROCARBONS, OILS, AND LIPIDS, rok: 2017, počet stran: 21 s.
-
Watergate: Visual Exploration of Water Trajectories in Protein Dynamics
Eurographics Workshop on Visual Computing for Biology and Medicine, rok: 2017
2016
-
HotSpot Wizard 2.0: Automated Design of Site-Specific Mutations and Smart Libraries in Protein Engineering
Nucleic Acids Research, rok: 2016, ročník: 44, vydání: W1, DOI