Informace o projektu

Evoluce GC obsahu a genomu trav

Logo poskytovatele
Kód projektu
GP206/08/P222
Období řešení
1/2008 - 12/2010
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
Fakulta / Pracoviště MU
Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova
Poaceae, evoluce genomu, fylogeneze, velikost genomu, GC obsah, průtoková cytometrie, LTR retrotranspozony

Záměrem tohoto projektu je mapovat změny v obsahu GC bází (guaninu a cytosinu) související s fylogenezí druhů a globální evolucí genomu. Studium bude zaměřeno na modelovou čeleď Poaceae, vyznačující se nejvyšším a nejvariabilnějším GC obsahem v rámci vyšších rostlin, a bude postihovat všechny systematické úrovně, od rozdílů mezi čeleděmi, rody, druhy, až po vnitrodruhovou variabilitu. Dílčí studie jsou zaměřeny na: (i) sledování původu a následné evoluce vysokého GC obsahu genomu aa genů trav v rámci jednoděložných, (ii) sledování rozdílů v GC obsahu a velikosti chromozomů mezi hlavními evolučními liniemi trav, (iii) testování evolučního významu vysokého obsahu GC a následně vyšší termostability DNA pro rostliny z extrémních klimatických podmínek, (iv) prověření souvislosti změn obsahu GC s evolucí genomu v důsledku expanze a redukce mobilních elementů (na mezidruhové úrovni v rodě Oryza, na vnitrodruhové u Festuca pallens), a (v) na ověření možného využití měření obsahu GC a velikosti genomu pro mapování těchto procesů.

Publikace

Počet publikací: 14


Předchozí 1 2 Další